Depois que Max e Meowth poram levados por Deoxys, a Pokémon Ranger Solana recebeu um telefonema alertando-a sobre o aumento dos raios solares e que o ponto de onde esses raios são mais fortes é de dentro da caverna onde está Deoxys e o Meteorito. Com isso Ash, seus amigos, Solana e a Equipe Rocket resolvem voltar a caverna para resgatar Meowth e Max e ajudar Deoxys.
Sentindo a presença de Ash e os outros Deoxys volta a ter uma crise.
Solana descobre que o que está sendo atingido pelos raios solares era o meteorito, então todos saem da caverna sem Meowth e Max, pois Solana fala que lá era perigoso de mais, ela descobre também que o combinado dos raios solares e a força do meteorito fizeram com que o núcleo desse se transformasse em um Deoxys, mas como esse combinado estava causando aletrações geo magnéticas Deoxys teve que sair do meteorito (sua casa) o mais rápido possível.
Passado esses descobrimentos e já do lado de fora da caverna, Deoxys aparece e Solana tenta capturá-lo com a ajuda de Ash, May e Brock mas não tem sucesso.
Ash então escolhe Sceptile que com um raio solar, deixa Deoxys imobilizado, e com isso Solana finalmente consegue capturá-lo e pedir para ele se recuperar acabando com seusofrimento.
Derrepente se abre uma fenda no espaço (era na verdade uma dimensão onde Deoxys estava morando), e May, Jesse e James conseguem resgatar Max e Meowth. Depois o Meteorito explode mas Deoxys entra na frnte e usa proteger para salar os humanos e pokémon.
Agora Deoxys vai passear pela terra conhecendo novos lugares, novos amigos e novoss pokémons.